一章书发表：GO语义相似性度量

介绍GOSemSim的推文写的不多，只有下面几篇：

但GOSemSim是我写过的第一个R包，2008年就在Bioconductor上，是一个伴随我早期成长的R包，我的第一篇SCI论文，就是写GOSemSim，2010年发表在Bioconductor上，目前已经超过500篇引用，被应用于生物信息学的诸多方面。

我收到了《Stem Cell Transcriptional Networks》这本书主编的邀请，在书中为GOSemSim写一章，这是Springer出版社大名鼎鼎的《Methods in Molecular Biology》系列中的一本书。正好我觉得我第一篇SCI论文发表10年，来个呼应，于是爽快地答应了。

我在书中介绍了语义相似性度量的方法、GOSemSim和相关的包，然后就是应用实例，专门找了一个和干细胞有关的实例，并且还让ggtree也露一下脸，对语义相似矩阵进行聚类，用ggtree对聚类结果进行可视化。这个实例对于我们找蛋白功能簇是很有借鉴意义的，欢迎查阅。

https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-0716-0301-7_11

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